Fjala e fundit e Komandantit Kobra: Shpagimi, beri qe Forcat G.I Joe te rikthehen perseri. Kete radhe me nje mision akoma me te rendesishem: shpetimin e botes nga dominimi total i Kobras. Por kete here atyre u duhet ndihma e Gjeneralit Xho Kolton (Bruce Willis), te vetmit te cilit mund t’i besojne ne keto rrethana.